Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE3BQ13370 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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