Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B2Q13367 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B2Q13367 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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