Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME3Q13232 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME3Q13232 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME3Q13232 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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