Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3BQ13214 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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