Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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TRAF1Q13077 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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