Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 BUD13YGL174W 801 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 MAK16YAL025C 921 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YJR012CYJR012C 624 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SUE1YPR151C 621 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 VPS33YLR396C 2076 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 HXT5YHR096C 1779 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ZPR1YGR211W 1461 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 FOB1YDR110W 1701 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SSA2YLL024C 1920 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CUE3YGL110C 1875 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SLY41YOR307C 1362 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CDC55YGL190C 1581 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 EXO5YBR163W 1758 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PAL1YDR348C 1500 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 TDA2YER071C 381 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SAE2YGL175C 1038 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PDX1YGR193C 1233 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RPL17BYJL177W 555 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YKL044WYKL044W 321 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YLL044WYLL044W 447 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ARG80YMR042W 534 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YNL150WYNL150W 408 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RIO2YNL207W 1278 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CKA2YOR061W 1020 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YBR209WYBR209W 318 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PUF2YPR042C 3228 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 MSE1YOL033W 1611 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SWT1YOR166C 1377 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 PPR1YLR014C 2715 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 HAA1YPR008W 2085 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YDL034WYDL034W 345 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 SIT4YDL047W 936 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RPB3YIL021W 957 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YMR320WYMR320W 306 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YOL134CYOL134C 390 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ISU2YOR226C 471 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YOR379CYOR379C 339 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 CAM1YPL048W 1248 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 MRPL51YPR100W 423 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 YPR174CYPR174C 666 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 ASI3YNL008C 2031 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 VMA13YPR036W 1437 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 RVB1YDR190C 1392 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 STE24YJR117W 1362 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-NL1Q12391 UBP6YFR010W 1500 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 PUS1YPL212C 1635 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SIF2YBR103W 1608 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RAD53YPL153C 2466 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RPS11AYDR025W 471 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 COX26YDR119W-A 201 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SEC53YFL045C 765 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YGR035CYGR035C 351 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YIR020CYIR020C 303 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 CSE4YKL049C 690 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YKL070WYKL070W 510 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 AFB1YLR040C 675 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 COX8YLR395C 237 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 snR10snR10 245 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RRN3YKL125W 1884 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 ULA1YPL003W 1389 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MTL1YGR023W 1656 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 DBF4YDR052C 2115 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 PKP2YGL059W 1476 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 VHR1YIL056W 1923 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YER097WYER097W 330 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YFL068WYFL068W 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 LAG1YHL003C 1236 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RSM25YIL093C 795 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 REE1YJL217W 597 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 UNG1YML021C 1080 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MDG1YNL173C 1101 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 AGA1YNR044W 2178 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YOR203WYOR203W 354 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 DER1YBR201W 636 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 PDI1YCL043C 1569 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 POF1YCL047C 777 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MCH4YOL119C 1506 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 DHR2YKL078W 2208 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 ATG20YDL113C 1923 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YVC1YOR087W 2028 nt4.75□□□□□ -1.65
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