Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 PIN4YBL051C 2007 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PSK1YAL017W 4071 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MCM21YDR318W 1107 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 DUO1YGL061C 744 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGR149WYGR149W 1299 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YIL025CYIL025C 375 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MAK16YAL025C 921 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 SDH3YKL141W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RPL6AYML073C 531 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 AAH1YNL141W 1044 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YNL184CYNL184C 327 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 snR11snR11 258 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 JJJ1YNL227C 1773 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 ITT1YML068W 1395 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YER138CYER138C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YER160CYER160C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YJR027WYJR027W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YML039WYML039W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YML045WYML045W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YMR050CYMR050C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 DSS1YMR287C 2910 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 CIK1YMR198W 1785 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YCL076WYCL076W 744 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGL101WYGL101W 648 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 EDC1YGL222C 528 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 SCM4YGR049W 564 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YNL013CYNL013C 378 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MDJ2YNL328C 441 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 VPS28YPL065W 729 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 REG2YBR050C 1017 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 OXR1YPL196W 822 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 ABD1YBR236C 1311 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 TRM12YML005W 1389 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MSS2YDL107W 1056 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGL082WYGL082W 1146 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 CIR1YGR207C 786 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 THP2YHR167W 786 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YIL175WYIL175W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YNL109WYNL109W 546 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 HNT3YOR258W 654 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 CAF20YOR276W 486 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RFM1YOR279C 933 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YPR027CYPR027C 834 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 ARO4YBR249C 1113 nt2.59□□□□□ -1.99
USB1Q12208 AIM11YER093C-A 414 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 PPX1YHR201C 1194 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 MSA2YKR077W 1092 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 MRPL16YBL038W 699 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 TPK2YPL203W 1143 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 TIM12YBR091C 330 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 DSF2YBR007C 2211 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 MET6YER091C 2304 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 MET5YJR137C 4329 nt2.58□□□□□ -2
USB1Q12208 HFM1YGL251C 3564 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 TOM1YDR457W 9807 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 VPS30YPL120W 1674 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 VIP1YLR410W 3441 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 YKR015CYKR015C 1707 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 SNT1YCR033W 3681 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 YDR355CYDR355C 303 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 YGR039WYGR039W 312 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 BUD21YOR078W 645 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 YPL071CYPL071C 471 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 PRP8YHR165C 7242 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 ACA1YER045C 1470 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 SRC1YML034W 2505 nt2.57□□□□□ -2
USB1Q12208 MNT3YIL014W 1893 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 YOR296WYOR296W 3870 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 YCG1YDR325W 3108 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 NET1YJL076W 3570 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 EFG1YGR271C-A 702 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 YLR012CYLR012C 300 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 SFH1YLR321C 1281 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 YBL094CYBL094C 333 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 RSM19YNR037C 276 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 TAF3YPL011C 1062 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 PST1YDR055W 1335 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 MAL12YGR292W 1755 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 MAL32YBR299W 1755 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 VPS33YLR396C 2076 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 YKL222CYKL222C 2118 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 DIA2YOR080W 2199 nt2.56□□□□□ -2
USB1Q12208 FUN30YAL019W 3396 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 PPH3YDR075W 927 nt2.55□□□□□ -2
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