Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 RPL6AYML073C 531 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HUB1YNR032C-A 222 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 HMT1YBR034C 1047 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 GCN1YGL195W 8019 nt3.22□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 CSR2YPR030W 3366 nt3.21□□□□□ -1.89
TY3A-GQ12173 SHU2YDR078C 672 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RPS21BYJL136C 264 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YMR310CYMR310C 954 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RHO5YNL180C 996 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 UAF30YOR295W 687 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 CMD1YBR109C 444 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 snR43snR43 209 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 STP2YHR006W 1626 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PDR3YBL005W 2931 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 MSM1YGR171C 1728 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 ROM1YGR070W 3468 nt3.21□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 SEC27YGL137W 2670 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 GIS4YML006C 2325 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RPL17AYKL180W 555 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YPL276WYPL276W 438 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YPR050CYPR050C 414 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YAT2YER024W 2772 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YIL169CYIL169C 2988 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 HEH2YDR458C 1992 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YDL199CYDL199C 2064 nt3.2□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 VIP1YLR410W 3441 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YDL180WYDL180W 1644 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 CDH1YGL003C 1701 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PCL9YDL179W 915 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YDR355CYDR355C 303 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 SAM37YMR060C 984 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RFM1YOR279C 933 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YPL071CYPL071C 471 nt3.19□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TRM12YML005W 1389 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 CGR1YGL029W 363 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 DLS1YJL065C 504 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 LCL2YLR104W 396 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TRI1YMR233W 681 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 CAF20YOR276W 486 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YOR314WYOR314W 330 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YPR053CYPR053C 456 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 KTR6YPL053C 1341 nt3.18□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TIF4631YGR162W 2859 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RDI1YDL135C 609 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 DET1YDR051C 1005 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 SMT3YDR510W 306 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RPL30YGL030W 318 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YGL082WYGL082W 1146 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PET54YGR222W 882 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 LSM12YHR121W 564 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YIL089WYIL089W 618 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YAP5YIR018W 738 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YNL013CYNL013C 378 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TUM1YOR251C 915 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 BUD4YJR092W 4344 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TAF2YCR042C 4224 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 VPS3YDR495C 3036 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YPK3YBR028C 1578 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PBI1YPL272C 1554 nt3.17□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RPC37YKR025W 849 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YKR070WYKR070W 1059 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PHO88YBR106W 567 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 TSC11YER093C 4293 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 SLN1YIL147C 3663 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 CIN1YOR349W 3045 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 PST1YDR055W 1335 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 ACA1YER045C 1470 nt3.16□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 ILS1YBL076C 3219 nt3.15□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 MSS4YDR208W 2340 nt3.15□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 HFM1YGL251C 3564 nt3.15□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 YHR078WYHR078W 1659 nt3.15□□□□□ -1.9
TY3A-GQ12173 RMT2YDR465C 1239 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 ERG28YER044C 447 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YFL051CYFL051C 483 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YOR082CYOR082C 342 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 HNT3YOR258W 654 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 SPS4YOR313C 1017 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YOR365CYOR365C 2112 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 VPS28YPL065W 729 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 PIN4YBL051C 2007 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 POL2YNL262W 6669 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 ARP4YJL081C 1470 nt3.15□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 ITT1YML068W 1395 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 TOM70YNL121C 1854 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 LSM6YDR378C 261 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 GRX2YDR513W 432 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YGR149WYGR149W 1299 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YGR219WYGR219W 342 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YKR011CYKR011C 1062 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MED11YMR112C 396 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 HHF2YNL030W 312 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 snR11snR11 258 nt3.14□□□□□ -1.91
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