Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms