Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms