Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms