Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms