Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms