Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FMODQ06828 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FMODQ06828 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms