Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 snR9snR9 187 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 DAD1YDR016C 285 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RPC11YDR045C 333 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 MIG3YER028C 1185 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RTR1YER139C 681 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 LSB1YGR136W 726 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 BIO2YGR286C 1128 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 LRP1YHR081W 555 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 ERP1YAR002C-A 660 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RPS1BYML063W 768 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YBL055CYBL055C 1257 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 ATX2YOR079C 942 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 FSH3YOR280C 801 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RET3YPL010W 570 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 FOX2YKR009C 2703 nt4.68□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 DSL1YNL258C 2265 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YGR266WYGR266W 2106 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 TMA64YDR117C 1698 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 PHO87YCR037C 2772 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 MSK1YNL073W 1731 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RKM2YDR198C 1440 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YDR199WYDR199W 366 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YGR045CYGR045C 363 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YGR114CYGR114C 390 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 DCS2YOR173W 1062 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 FYV12YOR183W 390 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 ADF1YCL058W-A 342 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 FZO1YBR179C 2568 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YMR046CYMR046C 1323 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 ESA1YOR244W 1338 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RSC58YLR033W 1509 nt4.67□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 MCM2YBL023C 2607 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 PRP11YDL043C 801 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 SLX9YGR081C 633 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RRF1YHR038W 693 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 REE1YJL217W 597 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YNK1YKL067W 462 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 RPL15BYMR121C 615 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 TMC1YOR052C 453 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 MCM16YPR046W 546 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YBR090CYBR090C 369 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 GDT1YBR187W 843 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 POF1YCL047C 777 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 IKS1YJL057C 2004 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 VHS3YOR054C 2025 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 NHX1YDR456W 1902 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 YOL075CYOL075C 3885 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 SRO7YPR032W 3102 nt4.66□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 HOM3YER052C 1584 nt4.65□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 SPC105YGL093W 2754 nt4.65□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 PIG2YIL045W 1617 nt4.65□□□□□ -1.66
HRQ1Q05549 snR5snR5 204 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 LPP1YDR503C 825 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YGR190CYGR190C 366 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 MPC3YGR243W 441 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 SYM1YLR251W 594 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YLR252WYLR252W 306 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 HTA2YBL003C 399 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 CUR1YPR158W 759 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 JJJ1YNL227C 1773 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 SWI1YPL016W 3945 nt4.65□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 GAL4YPL248C 2646 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 VPS30YPL120W 1674 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 PRS5YOL061W 1491 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 RUD3YOR216C 1455 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 HSP30YCR021C 999 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 PHO13YDL236W 939 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 VPS74YDR372C 1038 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 RPL8AYHL033C 771 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 CIC1YHR052W 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 IRC9YJL142C 393 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 DSS4YPR017C 432 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 GDE1YPL110C 3672 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 TPD3YAL016W 1908 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YNR065CYNR065C 3351 nt4.64□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 ACE2YLR131C 2313 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 SDS23YGL056C 1584 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 GDS1YOR355W 1569 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 CHK1YBR274W 1584 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 PEX10YDR265W 1014 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 SRP21YKL122C 504 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 MRP49YKL167C 414 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 RPL17AYKL180W 555 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YNL109WYNL109W 546 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YOR131CYOR131C 657 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 RPS10AYOR293W 318 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 STV1YMR054W 2673 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 FRE1YLR214W 2061 nt4.63□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 CHL1YPL008W 2586 nt4.62□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 HUL4YJR036C 2679 nt4.62□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YIL029CYIL029C 429 nt4.62□□□□□ -1.67
HRQ1Q05549 YAE1YJR067C 426 nt4.62□□□□□ -1.67
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