Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms