Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms