Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms