Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms