Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR3Q03167 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR3Q03167 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms