Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLH2Q02577 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms