Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms