Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms