Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms