Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLTCQ00610 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms