Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC5P78333 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC5P78333 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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