Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOBP62745 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOBP62745 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOBP62745 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOBP62745 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOBP62745 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOBP62745 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOBP62745 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms