Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFC1P60507 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms