Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms