Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSCP56915 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSCP56915 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSCP56915 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSCP56915 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSCP56915 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSCP56915 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSCP56915 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms