Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF10P55107 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF10P55107 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF10P55107 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF10P55107 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF10P55107 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms