Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHBP55084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHBP55084 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHBP55084 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHBP55084 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms