Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms