Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D1P54289 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms