Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATN1P54259 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATN1P54259 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATN1P54259 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATN1P54259 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATN1P54259 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms