Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms