Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms