Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPAP53621 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPAP53621 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPAP53621 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPAP53621 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPAP53621 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPAP53621 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPAP53621 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPAP53621 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPAP53621 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPAP53621 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPAP53621 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPAP53621 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPAP53621 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPAP53621 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPAP53621 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms