Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms