Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2A1P52655 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms