Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms