Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms