Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms