Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP3P50461 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms