Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms