Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms