Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRIM1P49642 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms