Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPIAP49247 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPIAP49247 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPIAP49247 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPIAP49247 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPIAP49247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPIAP49247 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPIAP49247 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPIAP49247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPIAP49247 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPIAP49247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms