Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNBP48739 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms