Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms